初孙纲要打乱原来的地域限制成立“龙旗舰队”的+=章、张之洞和刘坤一都曾经表示不太理解，孙纲向李鸿章详细的解释了自己这么做的理由，李鸿章等人听后深以为然，也表示了同意和支持。/首.发
孙纲告诉李鸿章等人，清朝时遗留给海军的一个要命的遗产就是这个四支水师“画地而守”的战略方针，说是战时可以“联成一气”，而实际上因为这样人为的造成了四支海军舰队的互不统属，战时根本不能相互协同作战，而且由于四支海军舰队的实力相差过与悬殊，一旦哪一支舰队作战失利，会很容易的挫伤其它三支舰队的士气，导致消极避战的现象出现。
象在中法甲申战争中，福建师遭到法国远东舰队的偷袭全军复没之后，清廷调南洋舰队南下迎战法国远东舰队却屡遭抵制；甲午战争时南队同样不肯北上助战，都是很明显的例子。
甲午战争期间，方面的较量其实就是北洋水师和日本联合舰队之间的战斗，其它三支水师中，福建水师已经没有了作战能力，可以忽略不计；广东水师因为李鸿章的哥哥两广总督李瀚章的关系，广东水师战前把仅有的能够作战的三艘鱼雷巡洋舰调给了北洋，算是尽了最大的力量对北洋方面进行了支持；而南洋舰队的实力相对能强一些，直到甲午战争结束，也没有能够北上支援。
后来的丁酉战争中，这一状况也没有得到根本的改变，四支舰队还是各自为战，只是因为事前孙纲凭借私人关系的努力协调，使得四支舰队在执行作战任务时基本能作到一定程度上的配合，部分的起到了相互支援的作用。
出现这样地情，一是和清末时期中央权威衰落“地方不鸟中央”有关，另外一个重要的原因，就是这个人为的划分地域的关系。
现在，中国海军经过多年扩充，规模已经远远超出了清朝时期的水师，而且中国海军有了大型的战列舰和先进的新式装甲巡洋舰，拥有了一定的远洋作战能力，再面对外国来自海上地入侵，可以不必象清朝时期的那样“画地而守”地进行被动式的防御了，而是可以走向大洋，在海上消灭来犯之敌！
李鸿章、张之和刘坤一听了孙纲的解释之后，想起了当年的好多往事，不由得唏嘘不已。
当年他们都是封疆大，可以说是受尽了那个鸟朝廷的猜忌之苦，清廷为了防止地方势力坐大，也时不时地在他们这些汉臣当中人为的制造些“小矛盾”，作为牵制，让他们始终无法联合起来把主要地精力都集中于一项事业上，现在满清封建王朝已经不存在了，是时候该清理一下那个时代遗留下来的遗产了。
李鸿算是中国近代海军的始人，这些年虽然不直接参与海军的事务了，但也一直始终关注着中国海军的发展，他眼看着中国海军在战火中一步步的发展壮大，现在终于可以走出近海迈向大洋了，欣慰之余，在人事方面也尽可能地帮助孙纲对海军进行了协调。
中国海军“四洋”变成了“两洋”。这当中不可避免地要触动一些人地利益。孙纲最担心地其实就是人事方面地事。毕竟中国海军有“闽系海军”地外号。人事方面处理不当。可是会引发严重后果地。
海军改组之前。孙纲征了四位舰队司令地意见。因为毕竟成立“两洋海军”之后。大舰队司令由四个变成了两个。另外两个将担任分舰队司令。虽然说他和四洋舰队司令一直私交甚厚。但到自身地根本利益。他们还会会象以前一样地支持自己。还真不好说。
孙纲自己地想法是。由于叶祖圭继林泰曾去后担任北洋舰队司令多年。对北洋舰队地各项事务都极为熟悉。而且因为他在北洋舰队“禀性忠。上下敬服”。威望很高。北洋舰队地司令位置就不用动了。仍然由叶祖圭担任。
麻烦地其实是重组后地南洋舰队司令由谁来担任。
三位舰队司令“候选人”当中。程璧光和林国祥是广东人。刘步蟾是福建人。三人中程璧光年最小。担任这样地重要职务怕一些老人会不服。而以资历和威望以及战功。刘步都在林国祥和程璧光之上。而且刘步蟾是公认地“闽党”领袖。当年在清朝时就是取代丁汝昌担任北洋水师提督呼声最高地人。现在如果让刘步蟾担任南洋舰队司令。应该是一个不错地选择。
但对比刘步蟾。林国祥担任南洋舰队司令多年。在
队里面的威望也很高，战功也不比刘步蟾差多少，如蟾担任南洋舰队司令的话，南洋舰队原来的官兵未必会服，而如果让林国祥担任南洋舰队司令的话，“闽党”恐怕也会有意见。
孙纲把四洋舰队司令招集在一起开会，和他们当面把这个舰队改组的问题提了出来，想听听他们的意见，程璧光知道自己恐怕是没有希望参与这个“竞争”，因此明确表态他的才能不够担任如此的重要职务，宣布退出，而是向孙纲表示担任一个分舰队的司令就可以了。难题因此集中在了刘步和林国祥的身上。
程璧光退，出乎意料的是，林国祥也宣布退出，同意降格担任分舰队司令！
林国~孙纲说，自己“系鱼雷巡洋舰管带出身，未曾管带大舰，自督师南洋以来，兢兢业业，如履薄冰，如今海军新舰益多，深恐不胜所职，有负国望。今海军重组，愿重回战舰历练”。
林国祥虽然说的拐弯抹角含糊其词，但孙纲知道，他当年是邓世昌的战友，又是同乡，知道当年大清海军的派系之争所带来的危害，因此不愿意卷入这些无谓的竞争当中，而是宁可重新去当一位舰长。
孙纲在军界和场混的日子也不短了，对他们的这些云山雾罩的春秋说法早就习惯了，知道有些话说出来，哪些是真的哪些是假的，象林国祥说的，退出南洋舰队司令的竞争未必全部是真心话，可他想嫌干舰队司令太累，想重新回到战舰上，应该说不是假话。
林国祥是中国海军里面有的从马尾海战丰岛海战大东沟海战一路打过来的悍将，“每战必有斯人”，属于一位飞将军李广式的人物，舰队司令的文牍生涯对他来说简直是活受罪，倒不如驾驶着战舰和敌人在海上真刀真枪的打上一仗来得实在，因此他说的那些话，后半截应该是真的。
对于林国祥谦让，刘步蟾也客气的推让了一番，但孙纲看得出来，刘步此时此刻，想当大舰队司令的愿望分外的强烈。
大清北洋水师成立不久，刘步蟾就一直想成为“亚洲第一舰队”的提督，而当年李鸿章担心北洋水师为清一色的闽人把持，因此才让自己的同乡丁汝昌担任北洋水师提督，丁汝昌本是陆将，刚一上任时确实有“外行领导内行”的嫌疑，因此刘步蟾对这位陆军出身的海军司令不怎么买帐也是可以理解的，但后来随着丁汝昌全力投身于北洋水师的建设当中，为海军尽心服务多年，而且经过不断的努力学习，对海军事务从不懂到懂，最后成了连英国总教习琅威理都佩服的“内行”，刘步蟾想当北洋水师提督的愿望，从此遥遥无期。
甲午后，清廷~蟾调任福建水师提督，其实一方面有分化北洋实力的企图，另一方面也有平息“闽党”领袖不满的意思在里面。
现在，华夏和国龙旗海军第二大舰队司令的位置，对刘步蟾来说，有着无法比拟的诱惑力的。
孙纲经过仔细考虑，又在院和李鸿章张之洞等人商量之后，公布了海军重组后人事方面的安排，即中国海军取消海峡舰队和越洋舰队的编制，重新改组为“北洋舰队”和“南洋舰队”，北洋舰队的司令为海军中将叶祖圭，南洋舰队的司令为海军中将刘步蟾。
重组后的北洋舰队下辖一个战列舰分队（三艘战列舰）、六个巡洋舰分队（二十九艘巡洋舰）、一个驱逐舰分队（十四艘驱逐舰）、一个炮舰分队（十艘炮舰）和一个潜艇分队（十五艘潜艇），以旅顺口、威海卫为母港，主要作战任务为同敌国海军进行舰队主力决战，夺取制海权，封锁敌国舰队于港口等。
重组后的南洋舰队下辖一个战列舰分队（三艘老式战列舰，两艘近岸防御战列舰）、三个舰分队（十三艘巡洋舰）、一个驱逐舰分队（十四艘驱逐舰）、一个鱼雷艇分队（十二艘鱼雷艇）、一个炮舰分队（六艘炮舰）和一个潜艇分队（十六艘潜艇）。以上海、福州、基隆、广州、湛江为母港，主要作战任务为巡视海岸海岛、海岸防御、侦察、给商船队护航、通报敌情、宣示武力、护侨抚侨等。