等马芳率军追赶上的时候，就发现俺答已经撤走了。没有了这些人当累赘，蒙古人行军的速度极快，马芳根本追之不及，而且马芳也要先把自己当面的这些北虏给消灭了。
什么，你说这不是正宗的北虏？来来来，你好好看看马军门手上的刀，再看看这些首级，是不是朝廷规定的斩虏贼首级一颗，赏银二十两的正宗北虏首级，你说不是，那丘八爷手上的刀就要好好跟你说道说道了。
马芳指挥官军，将俺答用于断后的这数千人吃掉之之后，挑挑拣拣从中找出了一千五百余级，这就是骑兵作战最不好的一点了，大量的首级被战马踏坏，无法用于报功，这使得官军士卒很是心疼。
隆庆元年十月初八日，俺答率部撤回草原，官军胜利收复磨儿山，自此，隆庆元年八月以来的俺答入寇彻底结束了，马芳随即向京师报捷，官军前后大小四战，斩获北虏首级近三千，俺答仓皇逃窜，官军大获全胜。
朱载坖得知消息之后，自然是极为高兴了，这是自己即位以来的第一场大胜，虽然俺答破口而入，但是并没有攻克大明一个州县，所能够造成的损失也就是极为有限的。
朱载坖对此非常高兴，不仅对参战诸军以及将领们加以赏赐，以山西今岁被虏寇为由，减免了山西的赋税，同时命令兵部从优议功，对于朱载坖来说，这一仗算是长了他的脸面，马芳、曹邦辅、戚继光、李成梁都是他简拔任用的人，实践证明，他们能够战胜俺答，俺答要想再重演庚戌之变时绝不可能了。
朱载坖还下令将此战的情况尤其是官军的斩获昭告天下，遣英国公告庙，并且明发上谕：十六载之积愤，一朝挫其狂峰！
自嘉靖二十九年庚戌之变以来，俺答多次进犯，虽然官军严整边墙，加强防御，但是haul从来没有斩获如此之多，尤其是官军野战没有战败，这才是极大的振奋人心，经历此战之后，朱载坖才感觉有点皇帝的尊严了。他令宣大总兵曹邦辅与提督马芳查看边墙，制定计划，对宣大边墙也要展开全面的修葺。
而朱载坖在此后算是初步在朝堂之上树立了自己的威信，可以按照自己的心意来来推行改革了。而首先就是一份来自福建的奏疏，隆庆元年十月二十日，福建巡抚都御史涂泽民请开海禁，准贩东西二洋。盖东洋若吕宋、苏禄诸国，西洋若交趾、占城、暹罗诸国，皆我羁縻外臣，无侵叛。而特严禁贩倭奴者，比于通番接济之例，此商舶之大原也。
涂泽民的这份奏疏当即在朝廷引起了轩然大波，朝臣们为此争论不休，分成了两派，部分朝臣们认为海禁是大明祖制，而且开海会导致倭寇再次泛滥，不同意开海。
而很多出身于东南的臣子，出于各种原因，认为中国无需外夷货物，而外夷需要中国货物，致使利益外泄。而民为利所趋， 冒着犯法也私自下海，禁之不绝，这对国家有害。开海一是可解决私通之患，将其纳于官方政府管辖之中，二是可使沿海百姓获益，三是可以使得朝廷增加赋税。
开海与禁海两派，为此争论不休，而朱载坖却没有表现出任何倾向来，使得群臣猜不透朱载坖的想法。
在官员因为此事争论不休时，朱载坖却发出密诏，召原兵部尚书总督浙直胡宗宪赴京师陛见。
朱载坖也单独召见了李春芳、高拱、张居正和陈以勤诸位讲官阁臣，询问朝堂现在关于开海的看法，虽然大部分臣子还是持海禁的态度，但是支持开海的力量已经是一股不小的势力了。
高拱、张居正等人同样也支持开海，原因很简单，海贸的巨额利润，可以为朝廷带来丰厚的关税，解决朝廷的财政问题，朱载坖同样也是这个想法，开海的目的是什么？就是为了征收关税，掌握财源，同时朱载坖能够预料的到，一旦开海，就会有巨额的白银涌入大明，而这些白银，必须为朝廷所掌握，否则的话，大量白银不加限制的流入到地主商人手中，而朝廷的太仓依然是空空如也，对于大明来说并非什么好事。
同时这也违背了朱载坖开海的初衷。所以其实朱载坖的态度很明确，不是开不开海，而是怎么开海，或者说怎么征收到关税，充实朝廷的财政。
朝廷怎么在海上贸易的巨额利润中分得一杯羹，这才是朱载坖关心的问题。
朱载坖说道：“诸位都是饱学之士，前宋开海，市舶司岁入至五百万贯，丰饶国用，公私两便，乃是好事，今本朝开海，如何收取关税，以为朝廷聚财，诸位可有良策？”
高拱说道：“陛下，东南之利，舶商居其一，市舶之利颇助国用，臣以为应当效法前宋，行市舶司之制。”
高拱显然是做了充分准备的，向朱载坖详细介绍了两宋收取关税的制度，两宋对于海船，首先是征收纳舶脚，也就是按照船只的大小吨位征税。
其次就是官府抽解后，再行抽买的制度，所谓抽解，也叫抽分，就是对于海商贩运来的货物按照一定比例抽收，征收实物税，两宋一般实施，粗色、细色两种税率，所谓粗色，即体积大、价值便宜的货物。所谓细色，即体积小、价值贵的货物。
一般粗色十分之一，甚至十五分之一，细色十分之二，甚至会到十分之四的高税率。除了抽分之外，还有抽买，就是国家对舶来商品的强制收购。又称博买或榷买。同时对于部分商品，还实行禁榷制度，对海外进口商品禁止私人买卖，而由朝廷垄断经营。
大宋将海上贸易所得的商品分为两大类，一类为禁榷物，如玳瑁、牙犀、宾铁、珊瑚、玛瑙、乳香等仍由朝廷全部收购，实行专买、专卖，余下的商品在朝廷征税抽分之后，则允许普通商人自行贸易。