除了这些事情之外，最重要的就是缅甸、夷洲、哈密、大宁的移民问题，现在经过朝廷的整顿之后，北方的流民减少了很多，现在的问题是百姓不够了，倒不是说大明没有人了，对于大明来说，人口依然是有的，尤其是在北方，很多的百姓依然生活的很困难。
但是地方州县的官员并不愿意百姓大量的移民走，因为朝廷对于州县的考核中，钱粮始终是最大的方面，对钱粮找谁缴纳？还不是得处在百姓的头上，要是百姓大量移民走了，官员的考绩就无法完成，在现在的吏部考成中，要是连续三年得了下等，那是要被降调的。
为了自己的乌纱，官员们当然不愿意百姓迁走了，不仅是官员们不愿意，地主士绅们也不愿意，之前是百姓们多，土地少，地主们不愁找不到佃户，但是随着朝廷大量的向辽东、大宁等地移民，山东、河北、河南等地的流民大量的被朝廷迁移到辽东、辽南去了，原本在京师附近的大宁都司诸卫也搬迁到了辽河河套去了。
现在北方人地矛盾已经得到解决了，同时朝廷在天津、顺天府兴办的大量工场也需要大量的人力，这些都导致直隶、山东、河南等省份的劳动力不足，地方官员纷纷向朝廷上疏，请求暂停向辽东等地的移民。
不仅是北方，在南方也是如此，由于海上贸易的开展，整个南中国的经贸往来特别活跃，大明的丝绸、瓷器、茶叶、布匹都是非常畅销的货物，大量的劳动力进入各种工场之中，这使得大量的百姓从农村进入工场之中，对此很多地方官员都感到极为忧虑。
不少人在给朱载坖的上疏中都认为大量的百姓舍本逐末，会导致大明的粮食生产出现问题，因为江浙等地原本就是大明的粮仓，现在对于大明来说苏松的百姓认为进入工场做工比种田要挣得多，所以大量的劳动力都涌向城市，苏松等地已经从粮食的出产地变成了粮食的进口地。
很多大臣们对于此事是极为忧虑的，他们认为粮食是最重要的物资，一旦没有粮食，到时候是要出大事的，商贾百姓短视，朝廷不能短视啊。
尤其是对于夷洲的经略，进行的并不顺利，福建等地的百姓对于移民没什么兴趣，涂泽民这么多年也仅仅向夷洲移民了一万户，在夷洲也只设立了两县加以管辖，现在很多官员都上疏朱载坖，对于现在大明可能出现的粮食危机深感忧虑。
这可不是小事，粮食问题绝对是大事，朱载坖命令巡抚浙江都御史蔡国熙和巡抚南直隶都御史杨继盛，调查此事，收到朱载坖的命令之后，蔡国熙和杨继盛立即详细调查了相关的情况，随后向朱载坖上疏了。
现在浙江和南直隶，确实出现了百姓不愿意种粮的情况，因为种桑养蚕甚至是种植棉花的收入都比粮食要高的多，同时大量的百姓从农村来到城市，脱离了土地，也导致浙江、南直隶等处的粮食产量下降。
与粮食产量下降相对应的就是粮价的上涨，现在苏松等地的粮价已经涨到了每石六钱四分的高位，这还是最近苏松风调雨顺的情况下，要是一旦发生灾荒，粮价立即就要暴涨的，所以杨继盛和蔡国熙也认为这种情况要加以干涉才行，他们上疏朱载坖，请求朝廷要对这种事情采取措施，毕竟苏松等地是大明的粮仓。
对于粮价的上涨，朝廷的反应还是很快的，不管是内阁还是户部等有司衙门，迅速的上疏朱载坖，要求重视此事，查明现在浙江、南直隶的粮食生产情况。
很快在朱载坖的上谕下，户部行文苏州府、常州府、松江府、嘉兴府、杭州府、湖州府六府，要求当地衙门排查各府州县粮食种植的情况，查明粮价快速上涨的原因。
朱载坖也和内阁、户部还有东南出身的官员讨论东南粮价快速上涨的原因，其实朱载坖很清楚，粮价快速上涨的原因主意就是两点，开海之后，大量的白银涌入大明，导致通货膨胀，现在不仅仅是粮价在涨，各种商品也都在涨价，只是粮食的涨幅最大罢了。
还有就是大量百姓涌入城市打工，放弃了土地，农村的土地，即使在耕种的，也是种植桑蚕和棉花的多，毕竟这两样可以获取更高的收益。
南直隶州县的奏疏也很快到了朱载坖的案头，和朱载坖猜想的差不多，东南府州粮食产量减少的最主要原因就是粮食播种面积的减少，太仓奏报：耕地宜稻者十之六七，皆弃稻种花。
松江府和附近州县的情况就更加恶劣了，松江府上海县和嘉兴府崇德、桐乡一带，稻田面积的减少也主要是受棉花种植的排挤，沿海官民军灶共垦田大约200万亩，其中大半用于种棉。
松江府在奏报中称：“吾邑地产木棉，行于浙西诸郡，纺织成布，衣被天下，而民间赋税，公私之费，亦赖以济。故种植之广，与粳稻等。”
松江府的棉花播种面积已经达到了松江府田地面积的一半，除了棉花之外，桑蚕也会影响粮食的播种，不过和棉花比起来，桑蚕的影响要小的多。
嘉兴府除崇德、桐乡外，秀水县养蚕之风亦很浓厚，三至四月间因村妇多养蚕，故当地俗称四月为“蚕月”，湖州府的桑蚕养殖更加兴盛，农家岁计，唯赖以蚕，苏州府吴县、昆山、吴江一带， 养蚕之家亦不少，尤其是吴江县，有“蚕桑盛于两浙”之谚，养殖桑蚕虽然不占用耕地，但是对于人力的需要是极大的，也会影响到粮食的耕种。
经过统计，仅苏州、松江两府，比国初种植水稻的面积就减少了七百万亩，相当于减少了五分之一的耕种面积。不仅是水稻的减产，苏松等地的小麦也大量的减产。