在陈璘和申时行亲自查看了之后，在报知了朱载坖之后，选定了北洋水师的平远舰作为朱载坖的坐舰，之所以选定平远舰，是因为平远舰是北洋水师最新的一艘战舰，隆庆十五年才刚刚交付北洋水师的，体型也大，达到了三千料，空间大，便于随扈人员居住。
为了保障朱载坖，将平远舰上的部分火炮暂时撤下，同时加以整修，锦衣亲军对于舰上的所有水手逐个进行审查，保障水手的绝对可靠。
凌云翼则是调动官军和辽镇镇水师，沿路护卫，同时官军在陆地上随时准备接应，除此之外，凌云翼还以急递迅速向内阁告知了此事，请求内阁在天津速调大军和水师接应。
在一切准备就绪之后，隆庆十六年八月初三日，朱载坖和李皇后登上北洋水师平远舰，从大连出发，回銮京师，这次朱载坖只带了亲近臣子、内侍和少部分锦衣亲军，在北洋水师的护卫之下，前往天津。
北洋水师提督陈璘率领旗舰致远舰在前开路，岸上的官军随时准备接应，而得知朱载坖走海路回天津，张居正也是有些抓狂，当即命令京营和亲军诸卫前往护驾，还有顺天巡抚王锡爵，速调水师，前往接应，务必要保证朱载坖的安全。
朱载坖倒丝毫没有紧张的意思，上船之后去视察船上的各处，慰问这些水手的，在启航之前，这些水手们才得知平远舰成为朱载坖的坐舰，能够成为的皇帝的坐舰，对于这些水手们来说自然是无比荣耀的事情，对于这些水手们，朱载坖是极为和蔼的，他们大部分都和太子差不多大，算起来都可以算是朱载坖的子侄辈。
朱载坖详细询问他们的情况，专门记下他们的名字，朱载坖在登舰之前，就已经以皇帝的名义赏赐了这些水手们，然后朱载坖亲自询问这些水手们，甚至命令孟冲将自己所携带的点心之类的零食遍赏士卒们，同时命令随行的厨子就地取材，烹饪食物，朱载坖和这些士卒们一道分享。
朱载坖笑着对这些士卒们说道：“朕还是第一次坐海船，比不得诸位都是久经波涛的。”
见朱载坖如此随和，这些士卒们也不那么拘束了，这些士卒们都是长期在海上漂泊的，对于海上的见闻还是不少的，朱载坖也就向他们了解他们眼中的各国水师，在这些士卒们眼中，朝鲜、倭国的水师不足为虑，但是西洋的船只还是确实有可取之处，他们所见到的西洋帆船，航速比大明的要快一些，吃水也深，重心更低，也就是大明的船只更加稳定，尤其是远洋作战的时候，这点就很重要的。
朱载坖认真听取这些士卒们的意见，对于海上的生活，水手们普遍反映伙食太差，近海航行时还好，能够及时得到补充，但是一旦远洋作战，对于水手们来说就很痛苦了，常年累月没有淡水河新鲜蔬菜，时刻威胁着这些水手的的生命安全，对于这个问题，朱载坖也表示要考虑，最后总归是要解决的。
朱载坖对于这些水手们的生活还是很关心，朱载坖很清楚饮食对于水手尤其远洋水手，饮食还是很重要的，必须要予以满足的。
朱载坖在北洋水师的护卫之下向天津进发，沿途的官军在水陆护卫，凌云路等人更是要将朱载坖船队每日的行进路线都要详细奏报，同时顺天巡抚王锡爵也命令天津的水师前出汇合，一道护卫朱载坖前往天津。
朱载坖经过九天的航行，终于抵达了天津，顺天巡抚王锡爵等人在港口迎接，朱载坖在天津府稍事休息之后，从天津出发回到京师。
朱载坖回到京师之后，首先就是处理挤压的政务，虽然有张居正和太子监国，但是监国并不等于的能够处理一些军国重务，事关国家和战等事情这些都是要朱载坖本人亲自拍板的。
朱载坖回来之后，首先就是要处理这些挤压的政务，朱载坖先召见了阁部重臣们，了解李成梁在青海的动向，李成梁率军已经将海虏逐出了青海，大部分的海虏西逃去投奔盘踞在西域的瓦剌部，少部分的海虏向大明投降，现在李成梁已经基本控制了青海。
现在的问题就是大明应该怎么处理青海的问题，对于大明来说，除了西宁卫之外，青海其他地方实在是难以控制，青海气候苦寒，又是高原，对于大明来说很多官员都认为青海实际上对于大明无甚好处，但是朱载坖很清楚，青海对于大明来说是极为重要的。
首先是青海作为的大明经略西藏、西域的桥头堡，虽然青海苦寒，青海山脉纵横，峰峦重叠，湖泊众多，峡谷、盆地遍布。祁连山、巴颜喀拉山、阿尼玛卿山、唐古拉山等山脉横亘境内。青海的位置是极为重要的，在青海的四周，东北和东部与黄土高原、秦岭山地相过渡，北部与甘肃河西走廊相望，西北部通过阿尔金山和新疆塔里木盆地相隔，南与藏北高原相接，东南部通过山地和高原盆地与四川盆地相连。
不仅是地理位置重要，青海的草场对于大明来说确实是很重要，据李成梁的奏报，就在青海湖附近的金银滩草原，可以牧养的战马可达三十万匹，要是真有这么多的战马对于大明来说骑兵的战马就不缺乏。
除此之外，李成梁还奏报，青海所出产的青海骢，挽乘兼用，体格中等，体质结实，步伐灵活敏捷，善于翻山越岭，是优良的乘用战马，善走对侧步，俗称为”走马”。踏开疾步时，步跨大，速度快，鞍口平稳，骑乘舒适，耐粗放，耐劳苦，是官军骑兵和辎重兵适合的战马。
青海出产的战马，体格健壮，远胜蒙古马，冲刺能力强，要是朝廷能够充分利用青海的草场，大明的战马就不愁使用。