佛指舍利案尘埃落定后，林远仍留在京城筹备物流总控中心的完善事宜。案头堆积着各地驿站传来的物流报表，看似规整的数据下，却暗藏着令人不安的端倪——山西、河南两地的分拨中心货物周转效率骤降，标注着\"西北茶马互市物资\"的加急文书频繁被延误。
张居正神色严峻地将一叠弹劾奏折推到林远面前：\"贤侄，山西、河南等地的分拨中心乱象丛生。茶马互市的战马补给、茶砖运输屡屡受阻，商户联名上书称货物积压、运费暴涨，背后怕是有人蓄意破坏。\"奏折上密密麻麻的红批，皆是各地官员对分拨中心运转失灵的控诉。
林远展开泛黄的《大明物流舆图》，用朱砂重重标记山西平阳府和河南开封府。这两处作为连接西北商道与中原腹地的枢纽，如今却像卡在帝国物流咽喉的骨刺。\"大人，这两处分拨中心建成不过数月，若说因管理不善导致混乱，恐怕没这么简单。\"他指着地图上的标注，\"更蹊跷的是，这两地的主事官员，皆是去年突然调任的。\"
苏婉娘带着暗影小组连夜调查，三日后呈上的情报让人心惊。山西分拨中心主事李通，表面上是从五品转运使，实则是严党残余势力安插的亲信，其胞弟在胡文远旧部掌控的商号任职；河南分拨中心的王有德，上任后便将原本由天元镖局培训的物流人员尽数裁撤，换上了自家宗族子弟。\"掌柜，现在西北运来的战马草料在山西积压发霉，河南分拨中心对运往西北的茶砖加收'防潮费'，导致茶马互市几乎停滞。\"苏婉娘展开一卷卷商户联名诉状，\"更过分的是，他们私设关卡，对非指定商队加收'查验费'。\"
林远立即整理详细的调查报告，连同暗影小组获取的证据，一并呈递给张居正。在文渊阁议事时，林远神色凝重地向张居正与内阁大臣们陈述：\"诸位大人，如今物流分拨中心乱象，实为严党余孽妄图颠覆朝廷经济命脉。西北茶马互市关乎边疆稳定，若不及时整治，战马短缺将动摇边防根基，江南赋税也恐无法顺利运抵京城。\"
张居正翻阅着证据，目光如炬：\"此等恶行，断不可姑息！\"他当即将此事禀明万历皇帝。朝堂之上，万历皇帝阅览奏章后龙颜大怒，拍案道：\"竟敢在朕的眼皮子底下扰乱国之经济！着令即刻彻查！\"
皇帝下旨，由户部、工部联合成立专项调查组，任命林远为钦差协理，负责统筹调查事务。林远趁机向朝廷举荐，从物流学堂选拔二十名精通物流管理、算术统计的骨干，经吏部正式任命为朝廷特派员，随调查组一同前往山西、河南。这些特派员手持吏部文书与皇帝敕令，身份名正言顺。
然而，特派员们甫一抵达，便遭遇重重阻挠。在山西平阳府，李通阴阳怪气地指着堆满库房的货物：\"朝廷的规矩虽好，可如今运力不足，巧妇难为无米之炊啊。\"特派员们发现，库房中近半数马车都闲置不用，而马厩里的马匹大多瘦弱不堪。仔细盘查才知，李通将优质马车和马匹私下租给了关联商号，从中牟取暴利。
河南的情况更糟。王有德不仅拒绝执行新的管理制度，还煽动宗族人员闹事。当特派员要求清点库存时，库房管理员竟拿出伪造的账本，上面的货物出入记录漏洞百出。更危险的是，暗影小组传来消息，王有德正在秘密囤积兵器，意图武装自家势力，彻底掌控河南分拨中心。
林远意识到，常规手段已无法解决问题。他连夜修书张居正，请求调派锦衣卫协助彻查。同时，他让天枢护卫队伪装成运送西北茶马互市物资的商队，携带特制的\"蜡封账本\"和\"墨印竹简\"进入河南。这些\"蜡封账本\"的每一页纸张边缘都涂有特制蜡油，一旦翻动或篡改，蜡油便会留下裂痕和指纹；\"墨印竹简\"则在竹片内侧刻有微小的编号，竹简之间用特殊墨水书写，若被替换或抽页，墨迹的连贯性和编号顺序就会出现破绽。此外，商队中还安排了擅长口技和易容的暗影小组成员，他们暗中记录分拨中心人员的言行举止和货物操作流程。
锦衣卫的突然到来让王有德慌了手脚，但他仍负隅顽抗。当锦衣卫要查封库房时，其宗族子弟手持棍棒将众人团团围住。关键时刻，伪装成商队的天枢护卫队亮明身份，迅速控制住局面。查验账本时，蜡封的裂痕和不连贯的账目记录，以及竹简上混乱的编号，将王有德私收贿赂、故意积压货物的行径展露无遗。
山西这边，林远亲自带队突袭李通的私宅。在密室中，他们发现了大量与胡文远旧部往来的信件，以及记录着分赃明细的账册。更惊人的是，李通还计划将山西分拨中心的控制权卖给蒙古商人，换取对方在边境冲突中对大明的牵制。
随着调查深入，一张庞大的利益网络逐渐浮出水面。严党余孽通过安插亲信、勾结商贾、煽动地方势力，妄图将物流分拨中心变成他们敛财和颠覆朝廷的工具。他们不仅在运费上层层盘剥，还故意制造物流混乱，导致西北茶马互市停滞，边疆军需补给困难。
在确凿的证据面前，万历皇帝龙颜大怒，下旨将李通、王有德等涉案官员即刻革职查办，并交由三法司严审。林远则趁机对全国分拨中心进行了一次大整顿：建立官员任职回避制度，严禁地方官员亲属参与物流经营；推行\"双轨监督制\"，除了朝廷派任的监察御史，还从当地商户中选拔公正人士组成监督委员会；更创新性地设计了\"物流信用评级系统\"，对分拨中心的运营效率、廉洁程度进行量化评分，评分结果直接影响官员考核与商队合作意向。
然而，这场胜利并未让林远感到轻松。胡文远虽失去了在明面上的影响力，但他的残余势力转入地下，与严党余孽、海外势力勾结得更加紧密。处理完山西、河南的危机后，林远收到暗影小组传来的密报：有人在福建沿海秘密建造大型船队，船上装载的并非普通货物，而是大量硝石、硫磺等违禁品。
站在京城新落成的物流总控中心，林远望着墙上不断更新的物流动态图，每一个闪烁的光点都代表着一支商队的行踪。他深知，这场官商博弈远未结束，而天元镖局与严党余孽的较量，不过是更大危机的前奏。窗外，暴雨倾盆而下，正如即将席卷大明的惊涛骇浪，而他，必须为帝国守住这条至关重要的物流生命线。