朱载坖收到胡宗宪的奏疏之后，召集阁臣和部臣，将之前涂泽民的奏疏拿出来，问道：“涂泽民的奏疏，诸位都看过了吧，开海与否，诸位怎么看？”其实涂泽民的奏疏早就在京师流传了，对于是否开海，形成了尖锐对立的两派。
大部分出身东南的官员和在东南任职过的官员都认为再坚持海禁已经没有任何意义了，朝廷的海禁只不过是形同虚设，但是很多科道官员和北方出身的官员坚持认为要坚守祖制，坚持海禁。
群臣对此事意见不一，朱载坖决定民主一把，令京师四品以上，外地三品以上官员都可以就此事发表意见。
在朱载坖的命令下，京师的部堂大员们和外地的督抚们纷纷上疏就此事展开讨论，朱载坖发现了一个很奇特的事情，地方督抚不管是否出身于东南或者是有在东南任职的经历，大多都是支持开海的，他们的观点基本都是一致的，就是开海能够使得朝廷增加收入，缓解朝廷的财政危机。
而在京师官员中，兵部、户部、刑部等实务衙门基本上都是支持开海的，反对开海最激烈的就是礼部和都察院，他们高举祖制的大旗，要求朱载坖遵守祖制，清流的看法几乎是一致的就是要坚持禁海不动摇。
对此朱载坖只是置之一笑，正如唐顺之等人在奏疏中说的一样，海禁政策现在已经完全是一个笑话了，东南的走私已经半公开的情况，东南的督抚大员、州县官吏都很清楚走私的情况，大商人、大地主也多多少少与走私有关。
现在再谈什么海禁，无异于掩耳盗铃。
朱载坖在听取了官员们意见之后，再次召集阁臣们商量此事，这次是一体很简单，就是朱载坖已经决定开海了，但是要有充分的理由，毕竟朱重八有过禁海的诏书，朱载坖作为子孙，总不可能上来就说历史文件不具备现实意义吧，毕竟朱载坖还是朱元璋的子孙，必须要有说得过去的理由，何况名不正则言不顺，虽然大家都心知肚明，开海的主要目的是为了缓解朝廷的财政困难，但是这个理由是拿不到台面上来的，朱载坖召集阁臣们，也就是为了商议此事。
朱载坖说道：“开海大事，必得昭告天下，以何为辞，诸位可以教朕乎？”
在坐的都是词章才子，科第名家，这些事情根本难不倒他们，李春芳就认为，开海可以使得沿海的百姓，量议收税，民自乐从。既籍其出入，不但可以稽其奸弊，亦可用为我之耳目， 既可稽考出入，亦得少助军饷。
高拱则是认为，既然要选择一处开海，肯定是在福建为好，因为福建是沿海最贫穷的省份，也是海盗最猖獗的地方，高拱对朱载坖说道：“陛下，闽人滨海而居，非往来海中则不得食，禁之而私通如故，不若官明通之而制之以法， 自通番禁严而附近海洋鱼贩一切不通，故民贫而盗愈起，宜稍宽其法。”
高拱是从为了百姓生计的角度考量的，高拱认为，虽然同为沿海省份，但是福建不同于浙直，福建多山少田，粮食产出本就不足，百姓需要下海谋生，向福建的漳州、泉州，本地粮食产量严重不足，需要从广东的惠州、潮州购买粮食，若是开海，利用海运，福建的百姓就可以吃到平价的粮食，若是坚持海禁，广东的粮食走陆路抵达福建，一路的运费损耗，使得百姓根本无力承担，朝廷开海，是为了百姓生计。
同时，朝廷开海，也是为了安定海疆，招谕岛倭，以夷攻夷，立功报效， 坐令地方安堵，东南税赋之场，复旧生理。总而言之，朝廷开海，都是为了百姓的生计，千秋万代的大事，而不是为了些许银钱之事。
徐阶也认为，开海之后，使有力者既巳从商而无异心，则琐琐之辈自能各安本业，这样一来，这些社会不稳定因素就离开大明去海上闯荡了。而且徐阶认为，朝廷开海，不是对太祖祖制的违背，而正是对太祖圣训的坚持与遵守，因为朝廷的开海是于通之之中,寓禁之之法。
朱载坖不得不说，他们经过万寿帝君的调教，对于干这种事情，实在是手拿把掐，现在对于开海，基本达成了一个共识，就是现在择一地开海，以观成效，然后在视其情况，决定是否在其他地方开海。
开海就意味着征税，这个税怎么征，由谁征，这是现在争论很大的事情。部分官员认为，这事不必设立专司，派官远来驻扎非便，而增设供应、人役所费倍繁，不若于本府佐贰五员、岁委一员管理， 事无专属，既于原议不悖，且于事体为宜。就是直接委任地方州县衙门办理即可了。
朱载坖对于这种提议当即予以拒绝，地方州县，朱载坖信得过他们才有鬼了，他们连朝廷本该征解的税粮都收不齐，还指望他们征收海关关税，朱载坖觉得，到时候关税能够进了太仓那才是有鬼了。
朱载坖坚决要求设立专司管辖此事，而且是从中央到地方的一个全新衙门，将征解关税，打击走私，运输税银都交给这个衙门，所有的关税，全部征解太仓，由朝廷统一分配。不准地方插手此事。
朱载坖已经想好了，这个衙门就叫海关总署衙门，和大理寺 、通政司一样是正三品衙门，提督海关总署事务由户部左侍郎兼兵部左侍郎担任，下设缉私总兵和各地的缉私副将、参将、游击等打击走私的衙门，以及具体在港口征收关税的海关分司。
海关分司衙门的长官由户部郎中担任，同时派遣专门的巡关御史予以督察，地方巡按御史也有权稽核其账目。
现在朝廷仅打算开一口，在京师的海关总署衙门可以暂时不设，但是提督海关总署事务户部左侍郎兼兵部左侍郎必须先任命，朱载坖属意的人选就是胡宗宪，由胡宗宪筹建一处海关，然后再决定是否增设。