潘季驯在衙署中苦思冥想，朱载坖没有去召见他，而是跟自己的亲信臣子们商量起来怎么处理此事。
眼下的事情已经是十分明朗了，漕运、祖陵、百姓是不可能面面俱到的，必然是有所取舍的，潘季驯之前的想法是尽力保住祖陵和漕运，至于百姓，那就只能看天了。
朱载坖当然不能同意这种方案，但是朱载坖总不能明说自己对祖陵无所谓，可以放任祖陵被淹没，朱载坖毕竟是朱家的儿孙，这种话随便怎么都是说不出来的。
面对自己的心腹重臣，朱载坖不得不坦露心声，朱载坖说道：“如此看来，恐怕只有迁移祖陵了，两位先生以为如何？”
面对朱载坖的话，两位阁臣也在思量着，眼下的情况，似乎确实没有别的办法了。但是要迁移祖陵，哪里是一件容易的事情。不仅需要说得过去的理由，还需要巨额的投入，迁移祖陵，然后在重修一座祖陵，其中的投入是极大的。
高拱和陈以勤都不建议朱载坖这么做，原因很简单，首先祖陵风水，是很敏感的问题，虽然风水之说玄而又玄，但是谁也不敢否认风水，连太祖、成祖两位皇帝都不敢迁移祖陵，朱载坖作为后世之君，迁移祖陵就更加说不过去了，一旦因为迁移祖陵导致风水变化，这个责任谁来承担。
况且迁到何处去？不管是凤阳还是南京，似乎都有些说不过去。何况要想迁移祖陵，首先就是一笔庞大的开支，太祖、成祖倾尽天下三十余年建造的祖陵，弃之不用，又重新择地营建，不知道要花费多少银子，而且祖先安葬已久，再去惊扰，恐有未便。
高拱和陈以勤都认为这事不可行，朝廷上下绝对不会同意的，虽然说子不语怪力乱神，但是事涉祖陵，哪个官员敢保证祖陵迁移之后风水依旧，一旦后面出现天灾人祸，总会有好事者将此事和祖陵风水联系到一起，这就极为麻烦了。
朱载坖无奈的说道：“那如二位先生之见，就只有放弃淮泗百姓了吗？”
高拱和陈以勤只得沉默以对，朱载坖不由的无奈，只得先让他们回去。
过了两日，潘季驯请求召见，朱载坖当即单独召见潘季驯，潘季驯这几日不眠不休，衣衫凌乱，胡须都来不及整理，抱着一堆图纸，向朱载坖解释起来他自己的计划。
潘季驯承认，按照之前方案，必然是要牺牲泗州和淮泗之地的百姓的，因为为了保证漕运的通畅，要引黄淮之水济运河，而同时为了防止出现淮河淤积的情况，就必须束水冲沙，但是这样一来淮泗之间就成为行洪区，因为一旦春夏时节，黄淮泛滥，为了保证漕运和祖陵，必然要在泗州泄洪。
潘季驯经过苦思冥想，提出了导淮方案，总的来说，就是整体治理整个淮河，上游以蓄为主，中游蓄泄兼筹，下游以排为主，安排潘季驯的想法。
为了保障运河和束水冲沙的实施，肯定是要大筑高家堰的，一旦高家堰筑成，为了保障漕运，加上黄河夺淮入海，水量加大，原属淮河支流水系的沂、沭、泗河，因入淮无路，或淤塞、或壅成湖、或乱流东注入海，在淮泗之间的这些小湖泊就此蓄水，成为一个大湖。
这点和朱载坖的看法是一致的，潘季驯认为，有了这个大湖，可以蓄水，也可以行洪，与其如被动等待水淹，不如主动将该地区的百姓迁移走，将此处作为一个行洪蓄水的湖泊，同时将沂、沭、泗河的水也汇入此地。
同时，为了防止洪水，要重新挖出一条新河，用于导淮入海，经洪泽，清江浦、淮安，阜宁、射阳，滨海，这样的话，平时这条新河就承担灌溉、行船的事宜，一旦出来洪水，多余的洪水就从这条新河入海，用以分担淮河河道的压力。
按照潘季驯的规划，这条新河全长三百三十余里，一旦新河修成，整个淮泗之间对于洪水的抵御能力将会大幅度提升，但是泗州仍旧必不可保，潘季驯认为泗州地形过低，确实是无法保住。
朱载坖于是召见重臣们商议此事，得知潘季驯的规划之后，高拱首先提出了自己的疑问，朝廷要放弃一座泗州城，将大批的百姓迁移走，还要投入巨资新挖一条三百三十里的新河，除了保障漕运之外，朝廷还能得到什么？
这是高拱关注的重点，也是在场的臣子关心的要点，迁移安置数以万计的百姓和一座泗州城，新修三百多里的河道，所耗费的钱粮可谓是天量的，没有足够的利益，即便是朱载坖同意，恐怕也无法说服朝臣们。
潘季驯在地图上做了说明，一旦新河修成，原来盐城、阜宁、射阳等地的土地就可以得到灌溉，按照潘季驯的测算，新河修成之后，将会改变了数百年来黄河、淮河并患苏北的局面，楚州灌区、阜东灌区的六十余万亩的土地将会得到灌溉，同时将新河继续东引，东引灌区可以覆盖八十万亩的良田。
这些得到灌溉的良田可以用来安置从泗州等处迁移的百姓。这样的话，潘季驯认为，可以大幅度降低水患，新河修成以后，减轻了淮河干流的负担，减少了下游淹没损失，除非是五十年一遇的大洪水，正常情况下都可以行洪通过。
同时新河也可以发挥运输功能，潘季驯认为，新河修成之后，两淮盐场的食盐转运也会更加便利，这个问题也是要考虑的。
不过当潘季驯报出需要的银子之后，一众臣子们都不太淡定了，按照潘季驯的估算，修筑新河以及配套的灌渠加上高家堰，一共需耗银一百到一百二十万两，安置、转移百姓，最少需要八十万两，也就是说最少需要二百万两银子的投入，才能够将整个工程完结。
虽然不是一下子投入，但是二百万两这个数字确实令人难以接受，马森就表示：竭天下之财，保一河，岂可得乎？作为户部尚书，马森认为这个开支实在是过于浩大了。